Namiko Mitarai
Lektor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
Dynamic Modeling of Indole Glucosinolate Hydrolysis and Its Impact on Auxin Signaling
Vik, D., Mitarai, Namiko, Wulff, N., Halkier, Barbara Ann & Burow, Meike, 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, 16 s., 550.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of phase transitions in a model ecosystem of sessile species
Uekermann, F., Mathiesen, Joachim & Mitarai, Namiko, 13 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032409.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bifurcation of transition paths induced by coupled bistable systems
Tian, C. & Mitarai, Namiko, 7 jun. 2016, I: The Journal of Chemical Physics. 144, 21, 215102.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases
Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchronized switching of multiple toxin-antitoxin modules by (p)ppGpp fluctuation
Tian, C., Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 21 aug. 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 14, s. 8180-8189 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A scaling law of multilevel evolution: how the balance between within- and among-collective evolution is determined
Takeuchi, N., Mitarai, Namiko & Kaneko, Kunihiko, 4 feb. 2022, I: Genetics. 220, 2, 9 s., 182.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Existence of log-phase Escherichia coli persisters and lasting memory of a starvation pulse
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Svenningsen, Sine Lo, Sørensen, Michael Askvad & Mitarai, Namiko, 2022, I: Life Science Alliance. 5, 2, 9 s., e202101076.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Birth and Resuscitation of (p)ppGpp Induced Antibiotic Tolerant Persister Cells
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Veress, A., Harms, A., Mitarai, Namiko & Semsey, S., 15 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 6056.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene Expression Changes with Minor Effects on the Population Average Have Major Effects on the Occurrence of Cells with Extreme Protein Concentrations
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 2019, I: mSphere. 4, 1, s. 1-6 e00575-18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multistability with a Metastable Mixed State
Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nonideal behavior of intramolecular structure factor of dilute polymers in a theta solvent
Shimomura, K., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 051804Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Pedersen, M., Nissen, S., Mitarai, Namiko, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2011, I: Journal of Molecular Biology. 407, 1, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Gompertz Law emerges naturally from the inter-dependencies between sub-components in complex organisms
Yde, Pernille, Jensen, Majken Karoline, Mitarai, Namiko & Bhatt, Samir, 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 11 s., 1196.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fluid dynamics of dilatant fluid
Nakanishi, H., Nagahiro, S. & Mitarai, Namiko, 12 jan. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 1, s. 011401 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Shear Thickening Oscillation in a Dilatant Fluid
Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 25 feb. 2011, I: Journal of the Physical Society of Japan. 80, 3, s. 033801Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Lattice model of sweeping interface for drying process in water-granule mixture
Nakanishi, H., Yamamoto, R., Hayase, Y. & Mitarai, Namiko, 1 feb. 2007, I: Journal of the Physical Society of Japan. 76, 2, 024003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Experimental observation of shear thickening oscillation
Nagahiro, S., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 1 okt. 2013, I: EPL. 104, 2, 28002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simple model for wet granular materials with liquid cluster
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 dec. 2009, I: EPL. 88, 6, s. 64001Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hard-sphere limit of soft-sphere model for granular materials: Stiffness dependence of steady granular flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 19 feb. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 67, 2, 021301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Collisional granular flow as a micropolar fluid
Mitarai, Namiko, Hayakawa, H. & Nakanishi, H., 29 apr. 2002, I: Physical Review Letters. 88, 17, 174301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Wet granular materials
Mitarai, Namiko & Nori, F., 30 jun. 2006, I: Advances in Physics. 55, 1-2, s. 1-45 45 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Entrainment of noise-induced and limit cycle oscillators under weak noise
Mitarai, Namiko, Alon, U. & Jensen, Mogens Høgh, 1 jun. 2013, I: Chaos. 23, 2, 023125.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Linear stability analysis of rapid granular flow down a slope and density wave formation
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 25 maj 2004, I: Journal of Fluid Mechanics. 507, s. 309-334Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How pirate phage interferes with helper phage: Comparison of the two distinct strategies
Mitarai, Namiko, 7 feb. 2020, I: Journal of Theoretical Biology. 486, 9 s., 110096.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of diversity in a model ecosystem
Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Control of ribosome traffic by position-dependent choice of synonymous codons
Mitarai, Namiko & Pedersen, Steen, 8 okt. 2013, I: Physical Biology. 10, 5, 056011.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Instability of dilute granular flows on rough slope
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 okt. 2001, I: Journal of the Physical Society of Japan. 70, 10, s. 2809-2812Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions
Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainable diversity of phage-bacteria systems
Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli
Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spatiotemporal structure of traffic flow in a system with an open boundary
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 21 aug. 2000, I: Physical Review Letters. 85, 8, s. 1766-1769Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability analysis of collisional granular flow on a slope
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 30 sep. 2003, I: International Journal of Modern Physics B. 17, 22-24 II, s. 4290-4294 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Convective instability and structure formation in traffic flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2 nov. 2000, I: Journal of the Physical Society of Japan. 69, 11, s. 3752-3761Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity
Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 apr. 2005, I: Physical Review Letters. 94, 12, s. 128001 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coupled positive and negative feedbacks produce diverse gene expression patterns in colonies
Mitarai, Namiko, Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 7 apr. 2015, I: mBio (Print). 6, 2, e00059-15 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Velocity correlations in dense granular shear flows: Effects on energy dissipation and normal stress
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2007, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 031305Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability analysis of optimal velocity model for traffic and granular flow under open boundary condition
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 aug. 1999, I: Journal of the Physical Society of Japan. 68, 8, s. 2475-2478Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Erratum: Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow (Physical Review Letters (2005) 94 (128001))
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 13 jul. 2006, I: Physical Review Letters. 97, 1, 019902.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Granular flow: dry and wet
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simple Interaction Model for Particlly Wet Granular Materials
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 feb. 2010, I: A I P Conference Proceedings Series. 1227, s. 214-220Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12071632
Flest downloads
-
1916
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1475
downloads
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
842
downloads
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet