Kim Sneppen

Kim Sneppen

Professor


  1. Udgivet

    Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes

    Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ

    Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Organizational structure and communication networks in a university environment

    Mathiesen, Joachim, Jamtveit, B. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 82, 1, s. 016104 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity

    Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Upstream plasticity and downstream robustness in evolution of molecular networks

    Maslov, S., Sneppen, Kim, Astrup Eriksen, K. & Yan, K., 2004, I: BMC Evolutionary Biology. 4, s. 9-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Computational architecture of the yeast regulatory network: Workshop on Flexibility in Biomolecules, MAY 15-18, 2005 Tempe, AZ

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Biology. 2, 4, Sp. iss. Sl, s. S94-S100

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation

    Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Population cycles and species diversity in dynamic Kill-the-Winner model of microbial ecosystems

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 4 jan. 2017, I: Scientific Reports. 7, 39642.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Spreading out of perturbations in reversible reaction networks

    Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control

    Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Exploring the Link between Nucleosome Occupancy and DNA Methylation

    Lövkvist, Cecilia, Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 12 jan. 2018, I: Frontiers in Genetics. 8, 7 s., 232.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    DNA methylation in human epigenomes depends on local topology of CpG sites

    Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Härter, Jan Olaf Mirko, 20 jun. 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, 11, s. 5123-5132

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Modeling the spatial dynamics of culture spreading in the presence of cultural strongholds

    Lizana, G. L., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 28 jun. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 83, 6, s. 066116 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Time walkers and spatial dynamics of ageing information

    Lizana, G. L., Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 29 jan. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 4, s. 040603 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Genetic Regulatory Networks that count to 3

    Lehmann, M. & Sneppen, Kim, 1 jul. 2013, I: Journal of Theoretical Biology. 329, s. 15-19 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Spiky oscillations in NF-KB signalling

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2005, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, s. 10840-10845

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules

    Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 26 dec. 2007, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 52, s. 20815-9 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Relation of intracellular signal levels and promoter activities in the gal regulon of escherichia coli

    Krishna, S., Orosz, L., Sneppen, Kim, Adhya, S. & Semsey, S., 2009, I: Journal of Molecular Biology. 391, 4, s. 671-678

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks

    Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-62 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Signalling and Feedback in Biological Networks

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  25. Udgivet

    Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks

    Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-2462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules

    Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model

    Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Minimal model of spiky oscillations in NF-kB signaling

    Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2006, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, 4, s. 10840-10845

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Airborne Pathogens in a Heterogeneous World: Superspreading & Mitigation

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 okt. 2020, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  30. Udgivet

    Superspreading quantified from bursty epidemic trajectories

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 16 dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 7 s., 24124.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Emerging diversity in a population of evolving intransitive dice

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 17 nov. 2022, I: Physical Review E. 106, 5, 6 s., 054409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Superspreading of airborne pathogens in a heterogeneous world

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 maj 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 9 s., 11191.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks

    Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning

    Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  37. Udgivet

    Self organized scale-free networks from merging and regeneration

    Kim, B. J., Trusina, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 3, s. 369-372

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Locally self-organized quasicritical percolation in a multiple-disease model

    Juul, J. S. & Sneppen, Kim, 30 sep. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 3, s. 0036119 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Labyrinthine clustering in a spatial rock-paper-scissors ecosystem

    Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 8 apr. 2013, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 87, 4, s. 042702 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Clonal selection prevents tragedy of the commons when neighbors compete in a rock-paper-scissors game

    Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 26 jun. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 6, s. 061924 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Dynamical genetic regulation

    Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Komolgorov scaling from random force fields

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Sustained oscillations and time delay in gene expression of protein hesl

    Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2003, I: FEBS Letters. 541, s. 176-177

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Oscillating gene expressions in regulatory network: Forces, Growth and Form in Soft Condensed Matter: At the Interface between Physics and Biology

    Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Tiana, G., 2005, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. 160, s. 195-202

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model

    Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Targeted bacterial immunity buffres phage diversity

    Härter, Jan Olaf Mirko, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 21 aug. 2011, I: Journal of Virology. 85, 20, s. 10554-10560 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Collaboration between CpG sites is needed for stable somatic inheritance of DNA methylation states

    Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 4, s. 2235-2244

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Spatial Structure and Lamarckian Adaptation Explain Extreme Genetic Diversity at CRISPR Locus

    Härter, Jan Olaf Mirko & Sneppen, Kim, 1 aug. 2012, I: mBio. 3, 4, s. e00126

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 10093