Blegdamsvej - Det oprindelige institut for fysik på Blegdamsvej 15-21 rummer fire forskergrupper foruden instituttets ledelse og administration.

Rockefellerkomplekset - På Juliane Maries Vej 30 huser 5 forskergrupper indenfor astronomi og geofysik.

H. C. Ørsted Institutet - I Universi-tetsparken 5 bor nanofysikgruppen. På trods af de tre adresser er der god kontakt på tværs af instituttet, og der er mange fælles arrangementer.

Instituttets videnskabelige medarbejdere forsker og underviser i de fysiske fag - astronomi, geofysik, nanofysik og grundlæggende fysik. Instituttet har desuden en omfattende ekstern formidling af forskningsområderne og -resultaterne.

Instituttets forskere er organiseret i ti forskergrupper, og i tilknytning til grupperne har Niels Bohr Institutet 10 centre. Et center udspringer af en ekstern bevilling, som er så stor, at der er mulighed for at ansætte en gruppe mennesker i en længere periode.

Niels Bohr Institutet omfatter Niels Bohr Internationale Akademi. Akademiet, som er støttet af en finanslovsbevilling på 10 mio. kr., har til formål at tiltrække verdens bedste fysikere til kortere eller længere ophold på instituttet for at fostre nye ideer og skabe banebrydende resultater. Niels Bohr Internationale Akademi har blandt andet et stærkt sommerskole-program.

Derudover har Niels Bohr Institutet ca. 35 ingeniører og teknikere ansat til at bistå med eksperimenter og varetage instituttets tekniske infrastruktur, og endelig er der ca. 35 medarbejdere der varetager administration, kommunikation og biblioteksfunktionen.

Instituttet er præget af stor faglig ambition, kreativ nysgerrighed og en afslappet omgangsform.