Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
The COVID-19 pandemic: key considerations for the epidemic and its control
Ørskov, S., Nielsen, Bjarke Frost, Føns, S., Sneppen, Kim & Simonsen, L., jul. 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 408-420 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development
sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: P L o S One. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains
Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploring the contribution of exposure heterogeneity to the cessation of the 2014 Ebola epidemic
Uekermann, F., Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: PLoS ONE. 14, 2, 11 s., e0210638.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spreading of multiple epidemics with cross immunization
Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 13 sep. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 86, 3, Part 2, s. 036108 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages
Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy measures in complex networks
Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling value bubbles in an attention based economy
Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Time Delay as a Key to Apaptosis Induction in the p53 Network
Tiana, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2002, I: European Phys. Journal. vol. B 29, s. 135Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillations and temporal signalling in cells
Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Rapid Curtailing of the Stringent Response by Toxin-Antitoxin Encoded mRNases
Tian, C., Roghanian, Mohammad, Jørgensen, M. G., Sneppen, Kim, Sørensen, Michael Askvad, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, jul. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 14, s. 1918-1926Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks
Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas
Dahl-Jensen, Svend Bertel, Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stabilization of epigenetic states of CpG islands by local cooperation
Sormani, G., Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 2016, I: Molecular BioSystems. 12, 7, s. 2142-2146Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and communication in complex networks
Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simplified models of biological networks
Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 4 jan. 2010, I: Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. 9, 39, s. 43-59 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A communication perspective on network topologies
Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetics as a first exit problem
Sneppen, Kim & Aurell, E., 2002, I: Physical Review Letters. 88, 4, s. 048101 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading
Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes
Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Specificity and Stability in Topology of Protein Networks
Sneppen, Kim, 2002, I: Kexue (Shanghai). vol. 296, s. 910-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Scaling in fracture and refreezing of sea ice
Sneppen, Kim & Hansen, A. G., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 331, s. 291-296Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy and anti-hierarchy in real and scale free networks
Sneppen, Kim & Minnhagen, P., 2004, I: Physical Review Letters. 92, s. 178702Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Globalization in a nutshell
Sneppen, Kim & Bornholdt, S., 29 okt. 2018, I: Physical Review E. 98, 4, 6 s., 022314.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Models of life: Dynamics and regulation in biological systems
Sneppen, Kim, 5 okt. 2014, Cambridge University Press udg. Cambridge. 342 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent
Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Overdispersion in COVID-19 increases the effectiveness of limiting nonrepetitive contacts for transmission control
Sneppen, Kim, Nielsen, Bjarke Frost, Taylor, R. J. & Simonsen, L., 6 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 14, 6 s., 2016623118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nucleosome dynamics and maintenance of epigenetic states of CpG islands
Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 28 jun. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 6, 062417.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stability Puzzles in λ Phage
Sneppen, Kim, 2002, I: Physical Review D (Particles, Fields, Gravitation and Cosmology). vol. E 65, s. 051914Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Profit Profiles in Correlated Markets
Sneppen, Kim, 2002, I: Physica B: Condensed Matter. vol. A 316, s. 561-567Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cooperative stabilization of the SIR complex provides robust epigenetic memory in a model of SIR silencing in Saccharomyces cerevisiae
Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 1 apr. 2015, I: Epigenetics. 10, 4, s. 293-302Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Mathematical Model for Transcriptional Interfernce by RNA Polymerase Traffic in Escherichia coli
Sneppen, Kim, Dodd, J., Shearwin, K., Palmer, A., Schubert, R., Callen, B. & Egan, B., 2005, I: Journal of Molecular Biology. 346, 2, s. 399-409Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Models of life: epigenetics, diversity and cycles
Sneppen, Kim, 1 apr. 2017, I: Reports on Progress in Physics. 80, 4, 042601.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Communication boundaries in networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M. & Trussina, A., 2005, I: Physical Review Letters. 94, 23, s. 238701Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification
Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffusion on complex networks: a way to probe their large-scale topological structures
Sneppen, Kim, Simonsen, I. & Eriksen, K., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 336, s. 163-173Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Restriction modification systems as engines of diversity
Sneppen, Kim, Semsey, S., Seshasayee, A. S. N. & Krishna, S., 2 jun. 2015, I: Frontiers in Microbiology. 6, 528.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple model for self organization of bipartite networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M., Trusina, A. & Minnhagen, P., 2004, I: EPL. 67, 3, s. 349-354Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein Interaction Networks Beyond Artifacts
Sneppen, Kim, 2002, I: FEBS. vol. 530, s. 255-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mismatch repair at stop codons is directed independent of GATC methylation on the Escherichia coli chromosome
Sneppen, Kim & Semsey, S., 5 dec. 2014, I: Scientific Reports. 4, 7436.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multistability with a Metastable Mixed State
Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple histone code opens many paths to epigenetics
Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability alignment identifies functional regions in tubulin paralogs
Sneppen, Kim, 2004, I: Protein Science. 13, s. 25-31Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease
Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection in complex networks: correlation profile of the internet
Sneppen, Kim, Maslov, S. & Zalizynak, A., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 333, s. 529-540Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physics in Molecular Biology
Sneppen, Kim & Zocchi, G., 2005, UK: Cambridge University Press. 319 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning
- Udgivet
Hide-and-seek on complex networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Measuring information networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions
Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fear and its implications for stock markets
Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signal integration in the galactose network of Escherichia coli
Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horváth, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., jul. 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-91 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis of Escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-7 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-4967Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Morphological Instabilities in a growing Yeast Colony: Experiment and Theory
Sams, T., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Christensen, B., Ellegaard, Clive Sigurd & Thrane, U., 14 jul. 1997, I: Physical Review Letters. 79, 2, s. 313-316Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Network models of phage-bacteria coevolution
Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and our limited information horizon
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling self-organization of communication and topology in social networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 1, s. 016108Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly of information in networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1109-1115Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and Cities: An Information Perspective
Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Searchability of networks
Rosvall, M., Grönlund, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, s. 046117Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Navigating netwoks with limited information
Rosvall, M., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 71, 6, s. 066111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pancreatic alpha and beta cells are globally phase-locked
Ren, H., Li, Y., Han, C., Yu, Y., Shi, B., Peng, X., Wu, S., Yang, X., Sneppen, Kim, Chen, L., Tang, C. & Zhang, T., 28 jun. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3721.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hitchhiking, collapse, and contingency in phage infections of migrating bacterial populations
Ping, D., Wang, T., Fraebel, D. T., Maslov, S., Sneppen, Kim & Kuehn, S., 1 aug. 2020, I: ISME Journal. 14, 8, s. 2007-2018 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quality control system response to stochastic growth of amyloid fibrils
Pigolotti, S., Lizana, L., Sneppen, Kim & Otzen, D., 2 maj 2013, I: F E B S Letters. 587, 9, s. 1405-1410 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator
Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Pedersen, M., Nissen, S., Mitarai, Namiko, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2011, I: Journal of Molecular Biology. 407, 1, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nanog, Oct4 and Tet1 interplay in establishing pluripotency
Olariu, V., Lövkvist, Cecilia & Sneppen, Kim, 5 maj 2016, I: Scientific Reports. 6, 25438.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nucleation and spreading of a heterochromatic domain in fission yeast
Obersriebnig, M. J., Pallesen, E. M. H., Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Thon, Genevieve, 2016, I: Nature Communications. 7, 11 s., 11518.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of supercoiling on the λ switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 1 jan. 2014, I: Bacteriophage. 4, 2, s. 1-5 5 s., e27517.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DNA supercoiling enhances cooperativity and efficiency of an epigenetic switch
Norregaard, K., Andersson, M., Sneppen, Kim, Nielsen, Peter E., Brown, Stanley & Oddershede, L. B., 22 okt. 2013, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 110, 43, s. 17386-91 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst
Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical tool bridging cell polarities with development of robust morphologies
Nissen, Silas Boye, Rønhild, S., Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 27 nov. 2018, I: eLife. 7, 25 s., e38407.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2
Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Differences in social activity increase efficiency of contact tracing
Nielsen, Bjarke Frost, Sneppen, Kim, Simonsen, L. & Mathiesen, Joachim, 2 okt. 2021, I: European Physical Journal B. 94, 10, 11 s., 209.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis
Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Lockdowns exert selection pressure on overdispersion of SARS-CoV-2 variants
Nielsen, Bjarke Frost, Eilersen, Andreas Thomas, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 2 sep. 2022, I: Epidemics. 40, 7 s., 100613.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation
Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The counterintuitive implications of superspreading diseases
Nielsen, B. F., Sneppen, Kim & Simonsen, L., 31 okt. 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 3 s., 6954.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts
Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The transcription factor Atf1 lowers the transition barrier for nucleosome-mediated establishment of heterochromatin
Nickels, Jan Fabio, Della-Rosa, M. E., Miguelez Goyeneche, I., Charlton, Sebastian Jespersen, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2022, I: Cell Reports. 39, 7, 17 s., 110828.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of diversity in a model ecosystem
Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions
Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainable diversity of phage-bacteria systems
Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli
Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity
Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations
Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2296
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2140
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1913
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet