Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
Model to Link Cell Shape and Polarity with Organogenesis
Nielsen, Bjarke Frost, Nissen, Silas Boye, Sneppen, Kim, Mathiesen, Joachim & Trusina, Ala, 10 jan. 2020, I: iScience. 23, 2, s. 1-10 10 s., 100830.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability alignment identifies functional regions in tubulin paralogs
Sneppen, Kim, 2004, I: Protein Science. 13, s. 25-31Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Need, greed and noise: competing strategies and in a trading model
Donangelo, R., Hansen, A., Sneppen, Kim & Souza, S. R., 2005, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 348, s. 496-504Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self organized scale-free networks from merging and regeneration
Kim, B. J., Trusina, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 3, s. 369-372Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Mathematical Model for Transcriptional Interfernce by RNA Polymerase Traffic in Escherichia coli
Sneppen, Kim, Dodd, J., Shearwin, K., Palmer, A., Schubert, R., Callen, B. & Egan, B., 2005, I: Journal of Molecular Biology. 346, 2, s. 399-409Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Navigating netwoks with limited information
Rosvall, M., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 71, 6, s. 066111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-4967Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal model of spiky oscillations in NF-kB signaling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2006, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, 4, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signalling and Feedback in Biological Networks
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- Udgivet
Networks and our limited information horizon
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and communication in complex networks
Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Network models of phage-bacteria coevolution
Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling of the genetic switch of bacteriophage TP901-1: a heteromer of CI and MOR ensures robust bistability
Hiizu, N., Pedersen, M., Alsing, A. & Sneppen, Kim, 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, s. 15-28 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple histone code opens many paths to epigenetics
Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks
Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-62 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hide-and-seek on complex networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying the benefits of translation regulation in the unfolded protein response
Axelsen, J. B. & Sneppen, Kim, 1 okt. 2004, I: Physical Biology. 1, 3, s. 159-165 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Thermodynamics of proteins: Fast folders and sharp transitions
Bakk, A., Dommersnes, P. G., Hansen, A., Høye, J. S., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 1 jan. 2002, I: Computer Physics Communications. 147, 1-2, s. 307-312 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The dynamics of phage predation on a microcolony
Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of Polycomb-Trithorax systems predicts that poised chromatin is bistable and not bivalent
Sneppen, Kim & Ringrose, L., 13 maj 2019, I: Nature Communications. 10, 18 s., 2133.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly, buckling and density-invariant growth of three-dimensional vascular networks
Kirkegaard, Julius Bier, Nielsen, Bjarke Frost, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 31 okt. 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 159, 8 s., 20190517.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy and anti-hierarchy in real and scale free networks
Sneppen, Kim & Minnhagen, P., 2004, I: Physical Review Letters. 92, s. 178702Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational architecture of the yeast regulatory network: Workshop on Flexibility in Biomolecules, MAY 15-18, 2005 Tempe, AZ
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Biology. 2, 4, Sp. iss. Sl, s. S94-S100Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Thermodynanics of Proteins: Fast Folders and Sharp Transitions
Bak, P., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 2002, I: Computer Physics Communications. vol. 147, s. 307-312Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly of information in networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1109-1115Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification
Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages
Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks
Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic Regulatory Networks that count to 3
Lehmann, M. & Sneppen, Kim, 1 jul. 2013, I: Journal of Theoretical Biology. 329, s. 15-19 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity
Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clonal selection prevents tragedy of the commons when neighbors compete in a rock-paper-scissors game
Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 26 jun. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 6, s. 061924 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Labyrinthine clustering in a spatial rock-paper-scissors ecosystem
Juul, J. S., Sneppen, Kim & Mathiesen, Joachim, 8 apr. 2013, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 87, 4, s. 042702 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffusion retardation by binding of tobramycin in an alginate biofilm model
Cao, B., Christophersen, L., Kolpen, Mette, Jensen, Peter Østrup, Sneppen, Kim, Høiby, Niels, Moser, Claus Ernst & Sams, T., 21 apr. 2016, I: P L o S One. 11, 4, 11 s., e0153616.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Multi stability and global bifurcations in epidemic model with distributed delay SIRnS-model
Jensen, G. G., Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2019, I: European Physical Journal B. 92, 2, 28.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination
Eriksen, M., Sneppen, Kim, Pedersen, Steen & Mitarai, Namiko, 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population cycles and species diversity in dynamic Kill-the-Winner model of microbial ecosystems
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 4 jan. 2017, I: Scientific Reports. 7, 39642.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
STUDY OF DECAY AND ABSORPTION OF THE DELTA-RESONANCE IN NUCLEI WITH A 4-PI DETECTOR
HENNINO, T., RAMSTEIN, B., BACHELIER, D., BOHLEN, HG., BOYARD, JL., ELLEGAARD, C., GAARDE, C., GOSSET, J., JOURDAIN, JC., LARSEN, JS., LEMAIRE, MC., LHOTE, D., MORSCH, HP., OSTERLUND, M., POITOU, J., RADVANYI, P., ROYSTEPHAN, M., SAMS, T., SNEPPEN, K., VALETTE, O. & 1 flere, , 4 jun. 1992, I: Physics Letters B: Particle Physics, Nuclear Physics and Cosmology. 283, 1-2, s. 42-46Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The uneasy coexistence of predators and pathogens
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 2 jul. 2020, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 7, 7 s., 42.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling value bubbles in an attention based economy
Toftdahl Olesen, C. & Sneppen, Kim, 2 mar. 2020, I: European Physical Journal B. 93, 3, 5 s., 36.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Regime Shifts in a Phage-Bacterium Ecosystem and Strategies for Its Control
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 nov. 2019, I: mSystems. 5, 4(6), e00470-19.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of networks of shared restriction-modification systems in phage-bacteria ecosystems
Eriksen, R. S., Malhotra, N., Seshasayee, A. S. N., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2022, I: Journal of Biosciences. 47, 3, 19 s., 38.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Epigenetic switching with asymmetric bridging interactions
Skjegstad, L. E. J., Nickels, Jan Fabio, Sneppen, Kim & Kirkegaard, Julius Bier, 20 jun. 2023, I: Biophysical Journal. 122, 12, s. 2421-2429 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relation of intracellular signal levels and promoter activities in the gal regulon of escherichia coli
Krishna, S., Orosz, L., Sneppen, Kim, Adhya, S. & Semsey, S., 2009, I: Journal of Molecular Biology. 391, 4, s. 671-678Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Visualization of large-scale correlations in gene expressions
Eriksen, K., Hörnquist, M. & Sneppen, Kim, 2004, I: Functional & Integrative Genomics. 4, 4, s. 241-245Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Searchability of networks
Rosvall, M., Grönlund, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, s. 046117Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Time Delay as a Key to Apaptosis Induction in the p53 Network
Tiana, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2002, I: European Phys. Journal. vol. B 29, s. 135Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification
Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network
Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Komolgorov scaling from random force fields
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillating gene expressions in regulatory network: Forces, Growth and Form in Soft Condensed Matter: At the Interface between Physics and Biology
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Tiana, G., 2005, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. 160, s. 195-202Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical genetic regulation
Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model
Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation
Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeted bacterial immunity buffres phage diversity
Härter, Jan Olaf Mirko, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 21 aug. 2011, I: Journal of Virology. 85, 20, s. 10554-10560 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally self-organized quasicritical percolation in a multiple-disease model
Juul, J. S. & Sneppen, Kim, 30 sep. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 3, s. 0036119 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horváth, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., jul. 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-91 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis of Escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-7 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physics in Molecular Biology
Sneppen, Kim & Zocchi, G., 2005, UK: Cambridge University Press. 319 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning
- Udgivet
Three is much more than two in coarsening dynamics of cyclic competitions
Mitarai, Namiko, Gunnarson, I., Pedersen, B. N., Rosiek, C. A. & Sneppen, Kim, apr. 2016, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 93, 042408.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Population Dynamics of Phage and Bacteria in Spatially Structured Habitats Using Phage lambda and Escherichia coli
Mitarai, Namiko, Brown, Stanley & Sneppen, Kim, 11 apr. 2016, I: Journal of Bacteriology. 198, 12, s. 1783-1793Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations
Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Kronik: Risikobaseret genåbning af Danmark kan give færre alvorligt syge og en hurtigere genåbning
Kirkeby, Carsten, Græsbøll, K., Halasa, T., Sneppen, Kim & Christiansen, L. E., 2020, I: Ingenøren.dk.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling
- Udgivet
Social contagion in a world with asymmetric influence
Halvorsen, G. S., Pedersen, B. N. & Sneppen, Kim, 3 feb. 2021, I: Physical Review E. 103, 2, 5 s., 022303.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Establishment of heterochromatin in domain-size-dependent bursts
Nickels, Jan Fabio, Edwards, A. K., Charlton, Sebastian Jespersen, Mortensen, A. M., Hougaard, S. C. L., Trusina, Ala, Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 13 apr. 2021, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 15, 11 s., e2022887118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On Phage Adsorption to Bacterial Chains
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Severe population collapses and species extinctions in multihost epidemic dynamics
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 22 aug. 2017, I: Physical Review E. 96, 2, 022412.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Optimal Transport Flows for Distributed Production Networks
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 22 maj 2020, I: Physical Review Letters. 124, 20, 5 s., 208101.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
COVID-19 superspreading suggests mitigation by social network modulation
Nielsen, Bjarke Frost, Simonsen, L. & Sneppen, Kim, 15 mar. 2021, I: Physical Review Letters. 126, 6 s., 118301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems
Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Host heterogeneity and epistasis explain punctuated evolution of SARS-CoV-2
Nielsen, Bjarke Frost, Saad-roy, C. M., Li, Y., Sneppen, Kim, Simonsen, L., Viboud, C., Levin, S. A., Grenfell, B. T. & Morozov, A. V. (red.), 15 feb. 2023, I: PLOS Computational Biology. 19, 2, 24 s., e1010896.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability of Individual Infectiousness Derived from Aggregate Statistics of COVID-19
Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 15 jan. 2021, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Collaboration between CpG sites is needed for stable somatic inheritance of DNA methylation states
Härter, Jan Olaf Mirko, Lövkvist, Cecilia, Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 1 feb. 2014, I: Nucleic Acids Research. 42, 4, s. 2235-2244Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spiky oscillations in NF-KB signalling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2005, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Scaling in fracture and refreezing of sea ice
Sneppen, Kim & Hansen, A. G., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 331, s. 291-296Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ
Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Specificity and Stability in Topology of Protein Networks
Sneppen, Kim, 2002, I: Kexue (Shanghai). vol. 296, s. 910-256Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillations and temporal signalling in cells
Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient chromosomal-scale DNA looping in Escherichia coli using multiple DNA-looping elements
Hao, N., Sneppen, Kim, Shearwin, K. E. & Dodd, I. B., 19 maj 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 9, s. 5074-5085Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene duplication models for directed networks with limits on growth
Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules
Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes
Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural correlations in bacterial metabolic networks
Gerlee, P. D. M., Bernhardsson, P. J. S., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 1 jun. 2010, I: FEBS Journal. 277, Suppl. 1, s. 114-114 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes
Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal Gene Regulatory Circuits that Can Count like Bacteriophage Lambda
Avlund, M., Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Krishna, S., 11 dec. 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, 4, s. 681-693Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Specific contacts of the -35 region of the galP1 promoter by RNA polymerase inhibit GalR-mediated DNA looping repression
Csiszovszki, Z., Lewis, D. E. A., Le, P., Sneppen, Kim & Semsey, S., 1 nov. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 20, s. 10064-10072 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Well-temperate phage: optimal bet-hedging against local environmental collapses
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2 jun. 2015, I: Scientific Reports. 5, 10523.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A cross-immunization model for the extinction of old influenza strains
Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 2016, I: Scientific Reports. 6, 8 s., 25907.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diversity Waves in Collapse-Driven Population Dynamics
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 1 sep. 2015, I: P L o S One. 11, 9, e1004440.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Degree landscapes in scale-free networks
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four simple rules that are sufficient to generate the mammalian blastocyst
Nissen, Silas Boye, Perera Pérez, Marta, Martin Gonzalez, Javier, Morgani, S. M. C., Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim, Brickman, Joshua Mark & Trusina, Ala, 12 jul. 2017, I: PLOS Biology. 15, 7, s. 1-30 e2000737.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2298
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2144
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1918
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet