Kim Sneppen

Kim Sneppen

Professor


  1. Udgivet

    Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens

    Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Superspreading quantified from bursty epidemic trajectories

    Kirkegaard, Julius Bier & Sneppen, Kim, 16 dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 7 s., 24124.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Detection in complex networks: correlation profile of the internet

    Sneppen, Kim, Maslov, S. & Zalizynak, A., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 333, s. 529-540

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Sustained oscillations and time delay in gene expression of protein hesl

    Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2003, I: FEBS Letters. 541, s. 176-177

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Distributions of Self Interactions and Voids in 1+1d Directed Percolation

    Huber, G., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 1 sep. 1995, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 52, 3, s. 2133-2136

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  6. Udgivet

    Networks and Cities: An Information Perspective

    Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology

    Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Spreading out of perturbations in reversible reaction networks

    Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks

    Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Key players in the genetic switch of bacteriophage TP901-1.

    Alsing, A., Pedersen, M., Sneppen, Kim & Hammer, K., 19 jan. 2011, I: Biophysical Journal. 100, 2, s. 313-321 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Organizational structure and communication networks in a university environment

    Mathiesen, Joachim, Jamtveit, B. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 82, 1, s. 016104 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Sustainability of Virulence in a Phage-Bacterial Ecosystem

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2010, I: Journal of Virology. 84, 6, s. 3016-3022 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters

    Bendtsen, K. M., Erdossy, J., Csiszovski, Z., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 2011, I: Nucleic Acids Research. 39, 16, s. 6879-6885 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Coexistence of phage and bacteria on the boundary of self-organized refuges

    Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 31 jul. 2012, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 109, 31, s. 12828-12833

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Protein Localization with Flexible DNA or RNA

    Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Axelrod model: accepting or discussing

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Why do phage play dice?

    Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., nov. 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-20 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Danske Universiteter 2020: Hvidbog til Forskningspolitisk årsmøde 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab

    Bache, C., Christiansen, F. B., Løkke, Anne, Smith, N. & Sneppen, Kim, 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab. 50 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportRapportRådgivning

  20. Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs

    Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Hierarchy measures in complex networks

    Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Deconstructing the principles of ductal network formation in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Yennek, S., Flasse, L., Larsen, Hjalte List, Sever, D., Karremore, G., Novak, Ivana, Sneppen, Kim & Botton, A., 2018, I: PLOS Biology. 16, 7, 25 s., e2002842.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Differentiation of developing olfactory neurons analysed in terms of coupled epigenetic landscapes

    Alsing, A. & Sneppen, Kim, 1 maj 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 9, 4755-4764.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Short-range growth inhibitory signals from the epithelium can drive non-stereotypic branching in the pancreas

    Dahl-Jensen, Svend Bertel, Figueiredo-Larsen, E. M., Botton, A. & Sneppen, Kim, 23 feb. 2016, I: Physical Biology. 13, 1, 016007.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Repression of the lysogenic PR promoter in bacteriophage TP901-1 through binding of a CI-MOR complex to a composite OM-OR operator

    Pedersen, M., Neergaard, J. T., Cassias, J., Rasmussen, K. K., Lo Leggio, Leila, Sneppen, Kim, Hammer, K. & Kilstrup, M., 26 maj 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 13 s., 8659.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Sustainable diversity of phage-bacteria systems

    Mitarai, Namiko, Marantos, Anastasios & Sneppen, Kim, 1 jun. 2023, I: Current Opinion in Systems Biology. 35, 6 s., 100468.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Airborne Pathogens in a Heterogeneous World: Superspreading & Mitigation

    Kirkegaard, Julius Bier, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 27 okt. 2020, I: medRxiv : the preprint server for health sciences. 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  29. Udgivet

    Jag1-Notch cis-interaction determines cell fate segregation in pancreatic development

    sgk681, sgk681, Seymour, Philip Allan, Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Egeskov-Madsen, A. L. R., Jørgensen, Mette Christine, Jensen, Mogens Høgh & Serup, Palle, 2023, I: Nature Communications. 14, 17 s., 348.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Upstream plasticity and downstream robustness in evolution of molecular networks

    Maslov, S., Sneppen, Kim, Astrup Eriksen, K. & Yan, K., 2004, I: BMC Evolutionary Biology. 4, s. 9-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Competition between diffusion and fragmentation: an important evolutionary process of nature

    Borg, J., Jensen, Mogens Høgh, Mathiesen, J. K., Olesen, Poul & Sneppen, Kim, 2003, I: Physical Review Letters. 91, s. 266103

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Epigenetics as a first exit problem

    Sneppen, Kim & Aurell, E., 2002, I: Physical Review Letters. 88, 4, s. 048101 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Modeling self-organization of communication and topology in social networks

    Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 1, s. 016108

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Synchronization model for stock market asymmetry

    Donangelo, R., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I. & Sneppen, Kim, 2006, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. L11001, s. 1-8

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks

    Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-2462

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Fear and its implications for stock markets

    Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization

    Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages

    Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Signal integration in the galactose network of Escherichia coli

    Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease

    Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Time walkers and spatial dynamics of ageing information

    Lizana, G. L., Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 29 jan. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 4, s. 040603 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Pathway identification by network pruning in the metabolic network of Escherichia coli

    Gerlee, P. D. M., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 2009, I: Bioinformatics. 25, 24, s. 3282-3288 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation

    Bæk, K. T., Svenningsen, Sine Lo, Eisen, H., Sneppen, Kim & Brown, Stanley, 2003, I: Journal of Molecular Biology. 334, 3, s. 363-372 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Emergence and decline of scientific paradigms

    Bornholdt, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2 feb. 2011, I: Physical Review Letters. 106, 5, s. 058701 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Barriers and Silencers: A Theoretical Toolkit for Control and Containment of Nucleosome-Based Epigenetic States

    Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 9 dec. 2011, I: Journal of Molecular Biology. 414, 4, s. 624-637

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Multistability with a Metastable Mixed State

    Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 5 sep. 2012, I: Physical Review Letters. 109, 10, s. 100602 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Spreading of multiple epidemics with cross immunization

    Uekermann, F. & Sneppen, Kim, 13 sep. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 86, 3, Part 2, s. 036108 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Longevity of orders in related to the longevity of their constituent genera rather then genus richness

    Bornholdt, S., Sneppen, Kim & Westphal, H., 2006, I: Theory in Biosciences. 128, 2, s. 75-83 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems

    Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: P L o S One. 4, 3, s. e4923

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Measuring information networks

    Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 10093