Namiko Mitarai
Lektor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages
Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A scaling law of multilevel evolution: how the balance between within- and among-collective evolution is determined
Takeuchi, N., Mitarai, Namiko & Kaneko, Kunihiko, 4 feb. 2022, I: Genetics. 220, 2, 9 s., 182.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Anomalous fluctuations in sliding motion of cytoskeletal filaments driven by molecular motors: Model simulations
Imafuku, Y., Mitarai, Namiko, Tawada, K. & Nakanishi, H., 7 feb. 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 5, s. 1487-1493Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Axelrod model: accepting or discussing
Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 apr. 2005, I: Physical Review Letters. 94, 12, s. 128001 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Bifurcation of transition paths induced by coupled bistable systems
Tian, C. & Mitarai, Namiko, 7 jun. 2016, I: The Journal of Chemical Physics. 144, 21, 215102.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Birth and Resuscitation of (p)ppGpp Induced Antibiotic Tolerant Persister Cells
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Veress, A., Harms, A., Mitarai, Namiko & Semsey, S., 15 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 6056.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Broad distribution of stick-slip events in slowly sheared granular media: Table-top production of a Gutenberg-Richter-like distribution
Bretz, M., Zaretzki, R., Field, S., Mitarai, Namiko & Nori, F., 2 jun. 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1116-1122Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of phase transitions in a model ecosystem of sessile species
Uekermann, F., Mathiesen, Joachim & Mitarai, Namiko, 13 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032409.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Circuit architecture explains functional similarity of bacterial heat shock responses
Masayo, I., Mitarai, Namiko & Trusina, Ala, 1 dec. 2012, I: Physical Biology. 9, 6, s. 066003Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Collisional granular flow as a micropolar fluid
Mitarai, Namiko, Hayakawa, H. & Nakanishi, H., 29 apr. 2002, I: Physical Review Letters. 88, 17, 174301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery
Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Control of ribosome traffic by position-dependent choice of synonymous codons
Mitarai, Namiko & Pedersen, Steen, 8 okt. 2013, I: Physical Biology. 10, 5, 056011.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Convective instability and structure formation in traffic flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2 nov. 2000, I: Journal of the Physical Society of Japan. 69, 11, s. 3752-3761Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Coupled positive and negative feedbacks produce diverse gene expression patterns in colonies
Mitarai, Namiko, Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 7 apr. 2015, I: mBio (Print). 6, 2, e00059-15 .Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deterministic extinction by mixing in cyclically competing species
Feldager, C. W., Mitarai, Namiko & Ohta, H., 20 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032318.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Distinct Survival, Growth Lag, and rRNA Degradation Kinetics during Long-Term Starvation for Carbon or Phosphate
Himeoka, Y., Gummesson, Bertil, Sørensen, Michael Askvad, Svenningsen, Sine Lo & Mitarai, Namiko, 20 apr. 2022, I: mSphere. 7, 3, 12 s., e01006-21.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Disturbance accelerates the transition from low- to high-diversity state in a model ecosystem
Botta, F. & Mitarai, Namiko, 4 feb. 2014, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 89, 2, 022704.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic Modeling of Indole Glucosinolate Hydrolysis and Its Impact on Auxin Signaling
Vik, D., Mitarai, Namiko, Wulff, N., Halkier, Barbara Ann & Burow, Meike, 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, 16 s., 550.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity
Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of bacterial populations under the feast-famine cycles
Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 27 mar. 2020, I: Physical Review Research. 2, 1, 15 s., 013372.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity
Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of diversity in a model ecosystem
Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of growth and dormancy from a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism
Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 30 dec. 2022, I: Physical Review Research. 4, 4, 23 s., 043223.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Entrainment of noise-induced and limit cycle oscillators under weak noise
Mitarai, Namiko, Alon, U. & Jensen, Mogens Høgh, 1 jun. 2013, I: Chaos. 23, 2, 023125.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Erratum: Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow (Physical Review Letters (2005) 94 (128001))
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 13 jul. 2006, I: Physical Review Letters. 97, 1, 019902.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Existence and construction of large stable food webs
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 sep. 2017, I: Physical Review E. 96, 3, 032406.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Existence of log-phase Escherichia coli persisters and lasting memory of a starvation pulse
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Svenningsen, Sine Lo, Sørensen, Michael Askvad & Mitarai, Namiko, 2022, I: Life Science Alliance. 5, 2, 9 s., e202101076.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Experimental observation of shear thickening oscillation
Nagahiro, S., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 1 okt. 2013, I: EPL. 104, 2, 28002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli
Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fluid dynamics of dilatant fluid
Nakanishi, H., Nagahiro, S. & Mitarai, Namiko, 12 jan. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 1, s. 011401 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations
Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems
Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene Expression Changes with Minor Effects on the Population Average Have Major Effects on the Occurrence of Cells with Extreme Protein Concentrations
Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 2019, I: mSphere. 4, 1, s. 1-6 e00575-18.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Granular flow: dry and wet
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hard-sphere limit of soft-sphere model for granular materials: Stiffness dependence of steady granular flow
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 19 feb. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 67, 2, 021301.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
How pirate phage interferes with helper phage: Comparison of the two distinct strategies
Mitarai, Namiko, 7 feb. 2020, I: Journal of Theoretical Biology. 486, 9 s., 110096.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Information spreading and development of cultural centers
Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Instability of dilute granular flows on rough slope
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 okt. 2001, I: Journal of the Physical Society of Japan. 70, 10, s. 2809-2812Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Lattice model of sweeping interface for drying process in water-granule mixture
Nakanishi, H., Yamamoto, R., Hayase, Y. & Mitarai, Namiko, 1 feb. 2007, I: Journal of the Physical Society of Japan. 76, 2, 024003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Linear stability analysis of rapid granular flow down a slope and density wave formation
Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 25 maj 2004, I: Journal of Fluid Mechanics. 507, s. 309-334Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Loewner driving functions for off-critical percolation clusters
Kondo, Y., Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 050102Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies
Dybiec, B., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling slow-processing of toxin messenger RNAs in type-I toxin-antitoxin systems: post-segregational killing and noise filtering
Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, mar. 2019, I: Physical Biology. 16, 2, 026001.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 12071632
Flest downloads
-
1911
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1473
downloads
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
840
downloads
Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet