Namiko Mitarai

Namiko Mitarai

Lektor


  1. Udgivet

    A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages

    Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    A scaling law of multilevel evolution: how the balance between within- and among-collective evolution is determined

    Takeuchi, N., Mitarai, Namiko & Kaneko, Kunihiko, 4 feb. 2022, I: Genetics. 220, 2, 9 s., 182.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Anomalous fluctuations in sliding motion of cytoskeletal filaments driven by molecular motors: Model simulations

    Imafuku, Y., Mitarai, Namiko, Tawada, K. & Nakanishi, H., 7 feb. 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 5, s. 1487-1493

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Axelrod model: accepting or discussing

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 apr. 2005, I: Physical Review Letters. 94, 12, s. 128001 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Bifurcation of transition paths induced by coupled bistable systems

    Tian, C. & Mitarai, Namiko, 7 jun. 2016, I: The Journal of Chemical Physics. 144, 21, 215102.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Birth and Resuscitation of (p)ppGpp Induced Antibiotic Tolerant Persister Cells

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Veress, A., Harms, A., Mitarai, Namiko & Semsey, S., 15 apr. 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 6056.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Broad distribution of stick-slip events in slowly sheared granular media: Table-top production of a Gutenberg-Richter-like distribution

    Bretz, M., Zaretzki, R., Field, S., Mitarai, Namiko & Nori, F., 2 jun. 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1116-1122

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Characterization of phase transitions in a model ecosystem of sessile species

    Uekermann, F., Mathiesen, Joachim & Mitarai, Namiko, 13 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032409.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Circuit architecture explains functional similarity of bacterial heat shock responses

    Masayo, I., Mitarai, Namiko & Trusina, Ala, 1 dec. 2012, I: Physical Biology. 9, 6, s. 066003

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Collisional granular flow as a micropolar fluid

    Mitarai, Namiko, Hayakawa, H. & Nakanishi, H., 29 apr. 2002, I: Physical Review Letters. 88, 17, 174301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery

    Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy

    Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Control of ribosome traffic by position-dependent choice of synonymous codons

    Mitarai, Namiko & Pedersen, Steen, 8 okt. 2013, I: Physical Biology. 10, 5, 056011.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Convective instability and structure formation in traffic flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2 nov. 2000, I: Journal of the Physical Society of Japan. 69, 11, s. 3752-3761

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Coupled positive and negative feedbacks produce diverse gene expression patterns in colonies

    Mitarai, Namiko, Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 7 apr. 2015, I: mBio (Print). 6, 2, e00059-15 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Deterministic extinction by mixing in cyclically competing species

    Feldager, C. W., Mitarai, Namiko & Ohta, H., 20 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032318.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Distinct Survival, Growth Lag, and rRNA Degradation Kinetics during Long-Term Starvation for Carbon or Phosphate

    Himeoka, Y., Gummesson, Bertil, Sørensen, Michael Askvad, Svenningsen, Sine Lo & Mitarai, Namiko, 20 apr. 2022, I: mSphere. 7, 3, 12 s., e01006-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Disturbance accelerates the transition from low- to high-diversity state in a model ecosystem

    Botta, F. & Mitarai, Namiko, 4 feb. 2014, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 89, 2, 022704.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Dynamic Modeling of Indole Glucosinolate Hydrolysis and Its Impact on Auxin Signaling

    Vik, D., Mitarai, Namiko, Wulff, N., Halkier, Barbara Ann & Burow, Meike, 2018, I: Frontiers in Plant Science. 9, 16 s., 550.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity

    Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs

    Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs

    Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter

    Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Dynamics of bacterial populations under the feast-famine cycles

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 27 mar. 2020, I: Physical Review Research. 2, 1, 15 s., 013372.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing

    Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity

    Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Efficient degradation and expression prioritization with small RANs

    Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Emergence of diversity in a model ecosystem

    Mitarai, Namiko, Mathiesen, Joachim & Sneppen, Kim, 30 jul. 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 86, 1, s. 011929 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Emergence of growth and dormancy from a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 30 dec. 2022, I: Physical Review Research. 4, 4, 23 s., 043223.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Entrainment of noise-induced and limit cycle oscillators under weak noise

    Mitarai, Namiko, Alon, U. & Jensen, Mogens Høgh, 1 jun. 2013, I: Chaos. 23, 2, 023125.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Erratum: Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow (Physical Review Letters (2005) 94 (128001))

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 13 jul. 2006, I: Physical Review Letters. 97, 1, 019902.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Existence and construction of large stable food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 sep. 2017, I: Physical Review E. 96, 3, 032406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Existence of log-phase Escherichia coli persisters and lasting memory of a starvation pulse

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Svenningsen, Sine Lo, Sørensen, Michael Askvad & Mitarai, Namiko, 2022, I: Life Science Alliance. 5, 2, 9 s., e202101076.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Experimental observation of shear thickening oscillation

    Nagahiro, S., Nakanishi, H. & Mitarai, Namiko, 1 okt. 2013, I: EPL. 104, 2, 28002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Fast Translation within the First 45 Codons Decreases mRNA Stability and Increases Premature Transcription Termination in E. coli

    Pedersen, Steen, Terkelsen, Thilde Bagger, Eriksen, M., Hauge, M. K., Lund, C. C., Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2019, I: Journal of Molecular Biology. 431, 6, s. 1088-1097 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Fluid dynamics of dilatant fluid

    Nakanishi, H., Nagahiro, S. & Mitarai, Namiko, 12 jan. 2012, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 85, 1, s. 011401 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Gene Expression Changes with Minor Effects on the Population Average Have Major Effects on the Occurrence of Cells with Extreme Protein Concentrations

    Svenningsen, Mikkel Skjoldan, Semsey, S. & Mitarai, Namiko, 2019, I: mSphere. 4, 1, s. 1-6 e00575-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Granular flow: dry and wet

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Hard-sphere limit of soft-sphere model for granular materials: Stiffness dependence of steady granular flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 19 feb. 2003, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 67, 2, 021301.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    How pirate phage interferes with helper phage: Comparison of the two distinct strategies

    Mitarai, Namiko, 7 feb. 2020, I: Journal of Theoretical Biology. 486, 9 s., 110096.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Information spreading and development of cultural centers

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Instability of dilute granular flows on rough slope

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 okt. 2001, I: Journal of the Physical Society of Japan. 70, 10, s. 2809-2812

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Lattice model of sweeping interface for drying process in water-granule mixture

    Nakanishi, H., Yamamoto, R., Hayase, Y. & Mitarai, Namiko, 1 feb. 2007, I: Journal of the Physical Society of Japan. 76, 2, 024003.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Linear stability analysis of rapid granular flow down a slope and density wave formation

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 25 maj 2004, I: Journal of Fluid Mechanics. 507, s. 309-334

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Loewner driving functions for off-critical percolation clusters

    Kondo, Y., Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 050102

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies

    Dybiec, B., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Modeling slow-processing of toxin messenger RNAs in type-I toxin-antitoxin systems: post-segregational killing and noise filtering

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, mar. 2019, I: Physical Biology. 16, 2, 026001.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 12071632