Namiko Mitarai

Namiko Mitarai

Lektor

ORCID: 0000-0003-0116-7606

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 85Pr. side: 50
Sortering: 1. forfatter
  1. Udgivet

    Protein Localization with Flexible DNA or RNA

    Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Udgivet

    Disturbance accelerates the transition from low- to high-diversity state in a model ecosystem

    Botta, F. & Mitarai, Namiko, 4 feb. 2014, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 89, 2, 022704.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Udgivet

    Broad distribution of stick-slip events in slowly sheared granular media: Table-top production of a Gutenberg-Richter-like distribution

    Bretz, M., Zaretzki, R., Field, S., Mitarai, Namiko & Nori, F., 2 jun. 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1116-1122

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens

    Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy

    Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery

    Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Motility mediates satellite formation in confined biofilms

    Cordero, Mireia, Mitarai, Namiko & Jauffred, Liselotte, 17 aug. 2023, I: ISME Journal. 17, s. 1819-1827 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Information spreading and development of cultural centers

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Axelrod model: accepting or discussing

    Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies

    Dybiec, B., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination

    Eriksen, M., Sneppen, Kim, Pedersen, Steen & Mitarai, Namiko, 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages

    Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    The dynamics of phage predation on a microcolony

    Eriksen, R. S., Larsen, Frej Andreas Nøhr, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 2024, I: Biophysical Journal. 123, 2, s. 147-156 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    On Phage Adsorption to Bacterial Chains

    Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Deterministic extinction by mixing in cyclically competing species

    Feldager, C. W., Mitarai, Namiko & Ohta, H., 20 mar. 2017, I: Physical Review E. 95, 3, 032318.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Valine-Induced Isoleucine Starvation in Escherichia coli K-12 Studied by Spike-In Normalized RNA Sequencing

    Gummesson, Bertil, Shah, S. A., Borum, A. S., Fessler, M., Mitarai, Namiko, Sørensen, Michael Askvad & Svenningsen, Sine Lo, 2020, I: Frontiers in Genetics. 11, 17 s., 144.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Udgivet

    Theory of invasion extinction dynamics in minimal food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 12 feb. 2018, I: Physical Review E. 97, 2, 10 s., 022404.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    Existence and construction of large stable food webs

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 sep. 2017, I: Physical Review E. 96, 3, 032406.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    Toxins, Targets, and Triggers: An Overview of Toxin-Antitoxin Biology

    Harms, A., Brodersen, D. E., Mitarai, Namiko & Gerdes, K., 7 jun. 2018, I: Molecular Cell. 70, 5, s. 768-784 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Distinct Survival, Growth Lag, and rRNA Degradation Kinetics during Long-Term Starvation for Carbon or Phosphate

    Himeoka, Y., Gummesson, Bertil, Sørensen, Michael Askvad, Svenningsen, Sine Lo & Mitarai, Namiko, 20 apr. 2022, I: mSphere. 7, 3, 12 s., e01006-21.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Udgivet

    Modeling slow-processing of toxin messenger RNAs in type-I toxin-antitoxin systems: post-segregational killing and noise filtering

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, mar. 2019, I: Physical Biology. 16, 2, 026001.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Emergence of growth and dormancy from a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 30 dec. 2022, I: Physical Review Research. 4, 4, 23 s., 043223.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    When to wake up? The optimal waking-up strategies for starvation-induced persistence

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 11 feb. 2021, I: PLoS Computational Biology. 17, 2, 21 s., 1008655.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Dynamics of bacterial populations under the feast-famine cycles

    Himeoka, Y. & Mitarai, Namiko, 27 mar. 2020, I: Physical Review Research. 2, 1, 15 s., 013372.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Food Web Assembly Rules for Generalized Lotka-Volterra Equations

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, feb. 2016, I: PLoS Computational Biology. 12, 2, e1004727.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Phage and bacteria support mutual diversity in a narrowing staircase of coexistence

    Härter, Jan Olaf Mirko, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2014, I: I S M E Journal. 28, 11, s. 2317-2326

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Anomalous fluctuations in sliding motion of cytoskeletal filaments driven by molecular motors: Model simulations

    Imafuku, Y., Mitarai, Namiko, Tawada, K. & Nakanishi, H., 7 feb. 2008, I: Journal of Physical Chemistry Part B: Condensed Matter, Materials, Surfaces, Interfaces & Biophysical. 112, 5, s. 1487-1493

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Loewner driving functions for off-critical percolation clusters

    Kondo, Y., Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 80, 5, Part 1, s. 050102

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Switching between oscillations and homeostasis in competing negative and positive feedback motifs

    Li, W., Krishna, S., Pigolotti, S., Mitarai, Namiko & Jensen, Mogens Høgh, 21 aug. 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 307, s. 205-210

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Modeling the spatial dynamics of culture spreading in the presence of cultural strongholds

    Lizana, G. L., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 28 jun. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 83, 6, s. 066116 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Udgivet

    From kill the winner to eliminate the winner in open phage-bacteria systems

    Marantos, Anastasios, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 8 aug. 2022, I: PLOS Computational Biology. 18, 8, 15 s., e1010400.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Udgivet

    Circuit architecture explains functional similarity of bacterial heat shock responses

    Masayo, I., Mitarai, Namiko & Trusina, Ala, 1 dec. 2012, I: Physical Biology. 9, 6, s. 066003

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity

    Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes

    Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    Simple model for wet granular materials with liquid cluster

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 dec. 2009, I: EPL. 88, 6, s. 64001

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Efficient degradation and expression prioritization with small RANs

    Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Speciation, diversification, and coexistence of sessile species that compete for space

    Mitarai, Namiko, Heinsalu, E. & Sneppen, Kim, 12 maj 2014, I: PloS One. 9, 5, s. e96665

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization

    Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    Stability analysis of collisional granular flow on a slope

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 30 sep. 2003, I: International Journal of Modern Physics B. 17, 22-24 II, s. 4290-4294 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Convective instability and structure formation in traffic flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2 nov. 2000, I: Journal of the Physical Society of Japan. 69, 11, s. 3752-3761

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Dynamic competition between transcription initiation and repression: Role of nonequilibrium steps in cell-to-cell heterogeneity

    Mitarai, Namiko, Semsey, S. & Sneppen, Kim, 13 aug. 2015, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 92, 2, 022710.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 apr. 2005, I: Physical Review Letters. 94, 12, s. 128001 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria

    Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Simple Interaction Model for Particlly Wet Granular Materials

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 feb. 2010, I: A I P Conference Proceedings Series. 1227, s. 214-220

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Granular flow: dry and wet

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2012, I: European Physical Journal. Special Topics. 204, 1, s. 5-17 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  47. Erratum: Bagnold scaling, density plateau, and kinetic theory analysis of dense granular flow (Physical Review Letters (2005) 94 (128001))

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 13 jul. 2006, I: Physical Review Letters. 97, 1, 019902.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Stability analysis of optimal velocity model for traffic and granular flow under open boundary condition

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 1 aug. 1999, I: Journal of the Physical Society of Japan. 68, 8, s. 2475-2478

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Velocity correlations in dense granular shear flows: Effects on energy dissipation and normal stress

    Mitarai, Namiko & Nakanishi, H., 2007, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 75, 3, s. 031305

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Coupled positive and negative feedbacks produce diverse gene expression patterns in colonies

    Mitarai, Namiko, Jensen, Mogens Høgh & Semsey, S., 7 apr. 2015, I: mBio (Print). 6, 2, e00059-15 .

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 12071632