Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- 2012
- Udgivet
Protein Localization with Flexible DNA or RNA
Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple histone code opens many paths to epigenetics
Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 2012, I: P L o S Computational Biology. 8, 8, 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Danske Universiteter 2020: Hvidbog til Forskningspolitisk årsmøde 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab
Bache, C., Christiansen, F. B., Løkke, Anne, Smith, N. & Sneppen, Kim, 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab. 50 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Rådgivning
- 2011
- Udgivet
Barriers and Silencers: A Theoretical Toolkit for Control and Containment of Nucleosome-Based Epigenetic States
Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 9 dec. 2011, I: Journal of Molecular Biology. 414, 4, s. 624-637Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ecosystems with Mutually Exclusive Interactions Self-Organize to a State of High Diversity
Mathiesen, Joachim, Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 25 okt. 2011, I: Physical Review Letters. 107, 18, s. 188101Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Locally self-organized quasicritical percolation in a multiple-disease model
Juul, J. S. & Sneppen, Kim, 30 sep. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 84, 3, s. 0036119 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Targeted bacterial immunity buffres phage diversity
Härter, Jan Olaf Mirko, Trusina, Ala & Sneppen, Kim, 21 aug. 2011, I: Journal of Virology. 85, 20, s. 10554-10560 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the spatial dynamics of culture spreading in the presence of cultural strongholds
Lizana, G. L., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 28 jun. 2011, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 83, 6, s. 066116 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence and decline of scientific paradigms
Bornholdt, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2 feb. 2011, I: Physical Review Letters. 106, 5, s. 058701 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Key players in the genetic switch of bacteriophage TP901-1.
Alsing, A., Pedersen, M., Sneppen, Kim & Hammer, K., 19 jan. 2011, I: Biophysical Journal. 100, 2, s. 313-321 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Bendtsen, K. M., Erdossy, J., Csiszovski, Z., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 2011, I: Nucleic Acids Research. 39, 16, s. 6879-6885 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Pedersen, M., Nissen, S., Mitarai, Namiko, Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2011, I: Journal of Molecular Biology. 407, 1, s. 35-44 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
- Udgivet
Minimal gene regulatory circuits for a lysis-lysogeny choice in the presence of noise
Avlund, M., Krishna, S., Semsey, S., Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 20 dec. 2010, I: PLoS ONE. 5, 12, s. 0015037 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A minimal model for multiple epidemics and immunity spreading
Sneppen, Kim, Trusina, Ala, Jensen, Mogens Høgh & Bornholdt, S., 18 okt. 2010, I: PLoS ONE. 5, 10, s. e13326Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Economy of operon formation: cotranscription minimizes shortfall in protein complexes
Sneppen, Kim, Pedersen, Steen, Krishna, S., Dodd, I. B. & Semsey, S., 21 sep. 2010, I: Microbe. 1, 4, s. e00177-10Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Organizational structure and communication networks in a university environment
Mathiesen, Joachim, Jamtveit, B. & Sneppen, Kim, 2 jul. 2010, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 82, 1, s. 016104 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theory for the stability and regulation of epigenetic landscapes
Micheelsen, M. A., Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Dodd, I. B., 4 jun. 2010, I: Physical Biology. 7, 2, s. 026010 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural correlations in bacterial metabolic networks
Gerlee, P. D. M., Bernhardsson, P. J. S., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 1 jun. 2010, I: FEBS Journal. 277, Suppl. 1, s. 114-114 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Sustainability of Virulence in a Phage-Bacterial Ecosystem
Heilmann, Silja, Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2010, I: Journal of Virology. 84, 6, s. 3016-3022 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Time walkers and spatial dynamics of ageing information
Lizana, G. L., Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 29 jan. 2010, I: Physical Review Letters. 104, 4, s. 040603 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simplified models of biological networks
Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 4 jan. 2010, I: Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure. 9, 39, s. 43-59 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
- Udgivet
Minimal Gene Regulatory Circuits that Can Count like Bacteriophage Lambda
Avlund, M., Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Krishna, S., 11 dec. 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, 4, s. 681-693Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., nov. 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-20 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horváth, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., jul. 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-91 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Benjamin, J. M., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Massé, E. & Sneppen, Kim, 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10655-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dominant negative autoregulation limits steady-state repression levels in gene networks
Semsey, S., Krishna, S., Erdossy, J., Horvath, P., Orosz, L., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2009, I: Journal of Bacteriology. 191, 14, s. 4487-4491 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamic features of gene expression control by small regulatory RNAs
Mitarai, Namiko, Bemjamin, J., Krishna, S., Semsey, S., Csiszovszki, Z., Masse, E. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 106, 26, s. 10655-10659 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of the recovery from sRNA-mediated gene silencing
Semsey, S., Bemjamin, J., Mitarai, Namiko, Krishna, S., Csiszovszki, Z., Sneppen, Kim & Masse, E., 2009, I: Cell Cycle. 8, 18, s. 2863-2864 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: P L o S One. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamics of uptake and metabolism of small molecules in cellular response systems
Werner, M., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: PLoS ONE. 4, 3, s. e4923Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling of the genetic switch of bacteriophage TP901-1: a heteromer of CI and MOR ensures robust bistability
Hiizu, N., Pedersen, M., Alsing, A. & Sneppen, Kim, 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, s. 15-28 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling proteasome dynamics in Parkinson's disease
Sneppen, Kim, Lizana, G. L., Jensen, Mogens Høgh, Pigolotti, S. & Otzen, D., 2009, I: Physical Biology. 6, 3, s. 036005Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pathway identification by network pruning in the metabolic network of Escherichia coli
Gerlee, P. D. M., Lizana, G. L. & Sneppen, Kim, 2009, I: Bioinformatics. 25, 24, s. 3282-3288 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reinforced communication and social navigation generate groups in model networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2009, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 79, 2, Part 2, s. 026111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Relation of intracellular signal levels and promoter activities in the gal regulon of escherichia coli
Krishna, S., Orosz, L., Sneppen, Kim, Adhya, S. & Semsey, S., 2009, I: Journal of Molecular Biology. 391, 4, s. 671-678Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Toolbox model of evolution of prokaryotic metabolic networks and their regulation
Maslov, S., Krishna, S., Pang, T. Y. & Sneppen, Kim, 2009, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 24, s. 9743-9748 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-11420 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
- Udgivet
Dynamical analysis on gene activity in the presence of repressors and an interfering promoter
Nakanishi, H., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 nov. 2008, I: Biophysical Journal. 95, 9, s. 4228-4240Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The generation of promoter-mediated transcriptional noise in bacteria
Mitarai, Namiko, Dodd, I. B., Crooks, M. T. & Sneppen, Kim, 11 jul. 2008, I: PLoS Computational Biology. 4, 7, s. e 10000109Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ultrasensitive gene regulation by positive feedback loops in nucleosome modification
Sneppen, Kim, Micheelsen, M. A. & Dodd, I. B., 15 apr. 2008, I: Molecular Systems Biology. 4, s. 182Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network
Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Dynamical genetic regulation
Jensen, Mogens Høgh, Krishna, S., Sneppen, Kim & Tiana, G., 2008, Springer. (Evolution from cellular to social scales, book series: Nato security through science series B: Physics and biophysics.Conference of the Nato-advanced study institute on evolution from cellular to social scales geilo, Norway april 10-20,2007, p.61-68.).Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene duplication models for directed networks with limits on growth
Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Komolgorov scaling from random force fields
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Angheluta, L., 2008, I: EPL. 84, 1, s. 10011 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillations and temporal signalling in cells
Tiana, G., Krishna, S., Pigolotti, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, I: Physical Biology. 4, 2, s. R1-R17Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Ribosome collisions and Translation efficiency: Optimization by codon usage and mRNA destabilization
Mitarai, Namiko, Sneppen, Kim & Pedersen, Steen, 2008, I: Journal of Molecular Biology. 382, 1, s. 236-245 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signalling and Feedback in Biological Networks
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2008, Dynamics on and of Complex Networks: Applications to Biology, computer Sciences, and the Social Sciences ( Modeling and Simulation in Sciences, Engineering and Technolo). Ganguly, N., Deutsch, A. & Mukherjee, A. (red.). Birkhäuser Verlag, s. Part 1 ( Biological Sciences)Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning
- 2007
Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules
Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 26 dec. 2007, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 52, s. 20815-9 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Combinatorics of feedback in cellular uptake and metabolism of small molecules
Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 52, s. 20815-20819Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Efficient degradation and expression prioritization with small RANs
Mitarai, Namiko, Andersson, A. M. C., Krishna, S., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physical Biology. 4, 3, s. 164-171Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Fear and its implications for stock markets
Simonsen, I., Ahlgren, P. H., Jensen, Mogens Høgh, Danangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 57, 2, s. 153-158Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Frustration driven stock market dynamics: Leverage effect and asymmetry
Heden Ahlgren, P. T., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I., Donangelo, R. & Sneppen, Kim, 2007, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 383, 1, s. 1-4 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling the two-hybrid detector: Experimental bias on protien interaction networks
Stibius, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Biophysical Journal. 93, 7, s. 2562-2566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling transcriptional interference and DNA looping in gene regulation
Dodd, I. B., Shearwin, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Journal of Molecular Biology. 369, 5, s. 1200-1213Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and our limited information horizon
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2007, I: International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering. 17, 7, s. 2509-2515Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signal integration in the galactose network of Escherichia coli
Semsey, S., Krishna, S., Sneppen, Kim & Adhya, S., 2007, I: Molecular Microbiology. 65, 2, s. 465-476Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spreading out of perturbations in reversible reaction networks
Maslov, S., Sneppen, Kim & Ispolatov, I., 2007, I: New Journal of Physics. 9, 273Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification
Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model
Krishna, S., Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2007, I: PLoS Computational Biology. 3, 3, s. 451-462Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
- Udgivet
Degree landscapes in scale-free networks
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A communication perspective on network topologies
Sneppen, Kim & Rosvall, M., 2006, I: Progress of Theoretical Physics. Supplement. s. 103-118Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Functional alignment of regulatory networks: a study of temperate phages
Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Dodd, I. B., Shearwin, K. E. & Egan, J. B., 2006, I: PLoS Computational Biology. 1, 7, s. 599-603Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-4967Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genetic regulation of fluxes: iron homeostasis of Escherichia coli
Semsey, S., Andersson, A. M. C., Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh, Massé, E. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 17, s. 4960-7 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Longevity of orders in related to the longevity of their constituent genera rather then genus richness
Bornholdt, S., Sneppen, Kim & Westphal, H., 2006, I: Theory in Biosciences. 128, 2, s. 75-83 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal model of spiky oscillations in NF-kB signaling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2006, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, 4, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling self-organization of communication and topology in social networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 1, s. 016108Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Network models of phage-bacteria coevolution
Rosvall, M., Dodd, I. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 6, s. 066105Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-assembly of information in networks
Rosvall, M. & Sneppen, Kim, 2006, I: EPL. 74, 6, s. 1109-1115Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and communication in complex networks
Sneppen, Kim, 2006, I: NATO Science Series : Sub Series III, Computer and sytems sciences. s. 1-28Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceartikel › Forskning › fagfællebedømt
Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks
Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-62 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structure and function of negative feedback loops at the interface of genetic and metabolic networks
Krishna, S., Andersson, A. M. C., Semsey, S. & Sneppen, Kim, 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 8, s. 2455-2462Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchronization model for stock market asymmetry
Donangelo, R., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I. & Sneppen, Kim, 2006, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. L11001, s. 1-8Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
- Udgivet
Measuring information networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., jun. 2005, I: Pramana – Journal of Physics. 64, 6, s. 1121-1125Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hide-and-seek on complex networks
Sneppen, Kim, Trusina, Ala & Rosvall, M., mar. 2005, I: EPL. 69, 5, s. 853-859Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Mathematical Model for Transcriptional Interfernce by RNA Polymerase Traffic in Escherichia coli
Sneppen, Kim, Dodd, J., Shearwin, K., Palmer, A., Schubert, R., Callen, B. & Egan, B., 2005, I: Journal of Molecular Biology. 346, 2, s. 399-409Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Communication boundaries in networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M. & Trussina, A., 2005, I: Physical Review Letters. 94, 23, s. 238701Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational architecture of the yeast regulatory network: Workshop on Flexibility in Biomolecules, MAY 15-18, 2005 Tempe, AZ
Maslov, S. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Biology. 2, 4, Sp. iss. Sl, s. S94-S100Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Navigating netwoks with limited information
Rosvall, M., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 71, 6, s. 066111Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Need, greed and noise: competing strategies and in a trading model
Donangelo, R., Hansen, A., Sneppen, Kim & Souza, S. R., 2005, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 348, s. 496-504Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Networks and Cities: An Information Perspective
Rosvall, M., Trusina, Ala, Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review Letters. 94, 2, 028701.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oscillating gene expressions in regulatory network: Forces, Growth and Form in Soft Condensed Matter: At the Interface between Physics and Biology
Jensen, Mogens Høgh, Sneppen, Kim & Tiana, G., 2005, I: NATO Science Series : Sub-Series II, Mathematics, Physics and Chemistry. 160, s. 195-202Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physics in Molecular Biology
Sneppen, Kim & Zocchi, G., 2005, UK: Cambridge University Press. 319 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning
- Udgivet
Searchability of networks
Rosvall, M., Grönlund, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 72, s. 046117Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning
- Udgivet
Self organized scale-free networks from merging and regeneration
Kim, B. J., Trusina, A., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 2005, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 3, s. 369-372Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Spiky oscillations in NF-KB signalling
Krishna, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2005, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 103, s. 10840-10845Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
- Udgivet
Quantifying the benefits of translation regulation in the unfolded protein response
Axelsen, J. B. & Sneppen, Kim, 1 okt. 2004, I: Physical Biology. 1, 3, s. 159-165 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Self-organization of structures and networks from merging and small-scale fluctuations
Minnhagen, P., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, 15 sep. 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 340, 4, s. 725-732Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy measures in complex networks
Trusina, Ala, Maslov, S., Minnhagen, P. & Sneppen, Kim, 30 apr. 2004, I: Physical Review Letters. 92, 17, 178702.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A simple model for self organization of bipartite networks
Sneppen, Kim, Rosvall, M., Trusina, A. & Minnhagen, P., 2004, I: EPL. 67, 3, s. 349-354Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Detection in complex networks: correlation profile of the internet
Sneppen, Kim, Maslov, S. & Zalizynak, A., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 333, s. 529-540Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffusion on complex networks: a way to probe their large-scale topological structures
Sneppen, Kim, Simonsen, I. & Eriksen, K., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 336, s. 163-173Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Hierarchy and anti-hierarchy in real and scale free networks
Sneppen, Kim & Minnhagen, P., 2004, I: Physical Review Letters. 92, s. 178702Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Robustness of the Right Operator in Bacteriophage µ
Metzler, R., Bakk, A. & Sneppen, Kim, 2004, I: Biophysical Journal. 86, s. 58-66Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Scaling in fracture and refreezing of sea ice
Sneppen, Kim & Hansen, A. G., 2004, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 331, s. 291-296Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sensitivity of phage µ upon variations of the gibbs free energy
Bakk, A., Sneppen, Kim & Metzler, R., 2004, I: Israel Journal of Chemistry. 44, s. 309-315Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Upstream plasticity and downstream robustness in evolution of molecular networks
Maslov, S., Sneppen, Kim, Astrup Eriksen, K. & Yan, K., 2004, I: BMC Evolutionary Biology. 4, s. 9-Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variability alignment identifies functional regions in tubulin paralogs
Sneppen, Kim, 2004, I: Protein Science. 13, s. 25-31Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Visualization of large-scale correlations in gene expressions
Eriksen, K., Hörnquist, M. & Sneppen, Kim, 2004, I: Functional & Integrative Genomics. 4, 4, s. 241-245Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2298
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2144
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1918
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet