Kim Sneppen
Professor
Biokompleksitet
Blegdamsvej 17
2100 København Ø
- Udgivet
Differentiation of developing olfactory neurons analysed in terms of coupled epigenetic landscapes
Alsing, A. & Sneppen, Kim, 1 maj 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, 9, 4755-4764.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Key players in the genetic switch of bacteriophage TP901-1.
Alsing, A., Pedersen, M., Sneppen, Kim & Hammer, K., 19 jan. 2011, I: Biophysical Journal. 100, 2, s. 313-321 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal Gene Regulatory Circuits that Can Count like Bacteriophage Lambda
Avlund, M., Dodd, I. B., Sneppen, Kim & Krishna, S., 11 dec. 2009, I: Journal of Molecular Biology. 394, 4, s. 681-693Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-11420 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Minimal gene regulatory circuits for a lysis-lysogeny choice in the presence of noise
Avlund, M., Krishna, S., Semsey, S., Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 20 dec. 2010, I: PLoS ONE. 5, 12, s. 0015037 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Why do phage play dice?
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., nov. 2009, I: Journal of Virology. 83, 22, s. 11416-20 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Correction to; Why Do Phage Play Dice? (vol 83, pg 11416, 2009)
Avlund, M., Dodd, I. B., Semsey, S., Sneppen, Kim & Krishna, S., 1 mar. 2012, I: Journal of Virology. 86, 5, s. 22898-2898 1 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quantifying the benefits of translation regulation in the unfolded protein response
Axelsen, J. B. & Sneppen, Kim, 1 okt. 2004, I: Physical Biology. 1, 3, s. 159-165 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
One hub-one process: a tool based view on regulatory network topology
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S. & Sneppen, Kim, 4 mar. 2008, I: BMC Systems Biology. 2, s. 25Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Degree landscapes in scale-free networks
Axelsen, J. B., Bernhardsson, S., Rosvall, M., Sneppen, Kim & Trusina, Ala, sep. 2006, I: Physical Review E (Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics). 74, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The cost and capacity of signaling in the Escherichia coli proetin reaction network
Axelsen, J. B., Krishna, S. & Sneppen, Kim, 24 jan. 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. s. P010018Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Danske Universiteter 2020: Hvidbog til Forskningspolitisk årsmøde 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab
Bache, C., Christiansen, F. B., Løkke, Anne, Smith, N. & Sneppen, Kim, 2012, Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab. 50 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Rådgivning
- Udgivet
Thermodynanics of Proteins: Fast Folders and Sharp Transitions
Bak, P., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 2002, I: Computer Physics Communications. vol. 147, s. 307-312Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sensitivity of phage µ upon variations of the gibbs free energy
Bakk, A., Sneppen, Kim & Metzler, R., 2004, I: Israel Journal of Chemistry. 44, s. 309-315Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Thermodynamics of proteins: Fast folders and sharp transitions
Bakk, A., Dommersnes, P. G., Hansen, A., Høye, J. S., Sneppen, Kim & Jensen, Mogens Høgh, 1 jan. 2002, I: Computer Physics Communications. 147, 1-2, s. 307-312 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Flow effects in intermediate-energy nuclear collisions
Barz, H. W., Bondorf, J. P., Donangelo, R., Elmér, R., Hansen, F. S., Jakobsson, B., Karlsson, L., Nifenecker, H., Schulz, H., Schussler, F., Sneppen, Kim & Söderström, K., 2 sep. 1991, I: Nuclear Physics, Section A. 531, 2, s. 453-460 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Bendtsen, K. M., Erdossy, J., Csiszovski, Z., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim, Krishna, S. & Semsey, S., 2011, I: Nucleic Acids Research. 39, 16, s. 6879-6885 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protein Localization with Flexible DNA or RNA
Bernhardsson, P. J. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 10 feb. 2012, I: PLoS.ONE.. 7, 2, s. e29218Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Competition between diffusion and fragmentation: an important evolutionary process of nature
Borg, J., Jensen, Mogens Høgh, Mathiesen, J. K., Olesen, Poul & Sneppen, Kim, 2003, I: Physical Review Letters. 91, s. 266103Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence and decline of scientific paradigms
Bornholdt, S., Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 2 feb. 2011, I: Physical Review Letters. 106, 5, s. 058701 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Longevity of orders in related to the longevity of their constituent genera rather then genus richness
Bornholdt, S., Sneppen, Kim & Westphal, H., 2006, I: Theory in Biosciences. 128, 2, s. 75-83 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Protection of bacteriophage-sensitive Escherichia coli by lysogens
Brown, Stanley, Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2 apr. 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 119, 4, e2106005119.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Bæk, K. T., Svenningsen, Sine Lo, Eisen, H., Sneppen, Kim & Brown, Stanley, 2003, I: Journal of Molecular Biology. 334, 3, s. 363-372 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diffusion retardation by binding of tobramycin in an alginate biofilm model
Cao, B., Christophersen, L., Kolpen, Mette, Jensen, Peter Østrup, Sneppen, Kim, Høiby, Niels, Moser, Claus Ernst & Sams, T., 21 apr. 2016, I: P L o S One. 11, 4, 11 s., e0153616.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conditional Cooperativity of Toxin - Antitoxin Regulation Can Mediate Bistability between Growth and Dormancy
Cataudella, I., Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 1 aug. 2013, I: PLoS Computational Biology. 9, 8, e1003174.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conditional Cooperativity in Toxin-Antitoxin Regulation Prevents Random Toxin Activation and Promotes Fast Translational Recovery
Cataudella, I., Trusina, Ala, Sneppen, Kim, Gerdes, K. & Mitarai, Namiko, 11 apr. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6424-6434Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Specific contacts of the -35 region of the galP1 promoter by RNA polymerase inhibit GalR-mediated DNA looping repression
Csiszovszki, Z., Lewis, D. E. A., Le, P., Sneppen, Kim & Semsey, S., 1 nov. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 20, s. 10064-10072 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deconstructing the principles of ductal network formation in the pancreas
Dahl-Jensen, Svend Bertel, Yennek, S., Flasse, L., Larsen, Hjalte List, Sever, D., Karremore, G., Novak, Ivana, Sneppen, Kim & Botton, A., 2018, I: PLOS Biology. 16, 7, 25 s., e2002842.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Theoretical analysis of epigenetic cell memory by nucleosome modification
Dodd, I. B., Micheelsen, M. A., Sneppen, Kim & Thon, Genevieve, 2007, I: Cell. 129, 4, s. 813-22 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Barriers and Silencers: A Theoretical Toolkit for Control and Containment of Nucleosome-Based Epigenetic States
Dodd, I. B. & Sneppen, Kim, 9 dec. 2011, I: Journal of Molecular Biology. 414, 4, s. 624-637Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling transcriptional interference and DNA looping in gene regulation
Dodd, I. B., Shearwin, K. & Sneppen, Kim, 2007, I: Journal of Molecular Biology. 369, 5, s. 1200-1213Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Need, greed and noise: competing strategies and in a trading model
Donangelo, R., Hansen, A., Sneppen, Kim & Souza, S. R., 2005, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 348, s. 496-504Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cooperativity in a trading model with memory and production
Donangelo, R. & Sneppen, Kim, 2002, I: Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. 316, 1-4, s. 581-591Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Synchronization model for stock market asymmetry
Donangelo, R., Jensen, Mogens Høgh, Simonsen, I. & Sneppen, Kim, 2006, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. L11001, s. 1-8Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Information spreading and development of cultural centers
Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 18 maj 2012, I: Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 85, 5, s. 056116 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Axelrod model: accepting or discussing
Dybiec, B. M., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 1 okt. 2012, I: European Physical Journal B. Condensed Matter and Complex Systems. 85, 10, s. 357Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modeling rises and falls in money addicted social hierarchies
Dybiec, B., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2014, I: Physica Scripta. 89, 8, 085002.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Cost-benefit of limited isolation and testing in COVID-19 mitigation
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 29 okt. 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 7 s., 18543.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Applying allometric scaling to predator-prey systems
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 8 feb. 2019, I: Physical Review E. 99, 2, 8 s., 022405.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Tradeoff between speed and reproductive number in pathogen evolution
Eilersen, Andreas Thomas, Nielsen, Bjarke Frost & Sneppen, Kim, 12 jun. 2023, I: Physical Review Research. 5, 2, 8 s., 023003.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The uneasy coexistence of predators and pathogens
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 2 jul. 2020, I: The European Physical Journal E: Soft Matter and Biological Physics. 43, 7, 7 s., 42.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
SARS-CoV-2 superspreading in cities vs the countryside
Eilersen, Andreas Thomas & Sneppen, Kim, 23 feb. 2021, I: A P M I S. Acta Pathologica, Microbiologica et Immunologica Scandinavica. 129, 7, s. 401-407 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chaos in disease outbreaks among prey
Eilersen, Andreas Thomas, Jensen, Mogens Høgh & Sneppen, Kim, 3 mar. 2020, I: Scientific Reports. 10, 7 s., 3907.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Gene duplication models for directed networks with limits on growth
Enemark, J. & Sneppen, Kim, 2008, I: Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment. 2007, s. P11007Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Visualization of large-scale correlations in gene expressions
Eriksen, K., Hörnquist, M. & Sneppen, Kim, 2004, I: Functional & Integrative Genomics. 4, 4, s. 241-245Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Occlusion of the ribosome binding site connects the translational initiation frequency, mRNA stability and premature transcription termination
Eriksen, M., Sneppen, Kim, Pedersen, Steen & Mitarai, Namiko, 14 mar. 2017, I: Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 362.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A growing microcolony can survive and support persistent propagation of virulent phages
Eriksen, R. S., Svenningsen, Sine Lo, Sneppen, Kim & Mitarai, Namiko, 1 jan. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS). 115, 2, s. 337-342Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Sustainability of spatially distributed bacteria-phage systems
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, s. 1-12 3154.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Emergence of networks of shared restriction-modification systems in phage-bacteria ecosystems
Eriksen, R. S., Malhotra, N., Seshasayee, A. S. N., Sneppen, Kim & Krishna, S., 2022, I: Journal of Biosciences. 47, 3, 19 s., 38.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On Phage Adsorption to Bacterial Chains
Eriksen, R. S., Mitarai, Namiko & Sneppen, Kim, 3 nov. 2020, I: Biophysical Journal. 119, 9, s. 1896-1904 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 10093
Flest downloads
-
2298
downloads
Direct and indirect effects in the regulation of overlapping promoters
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
2144
downloads
Single-cell Analysis of Lambda Immunity Regulation
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
1918
downloads
The functional half-life of an mRNA depends on the ribosome spacing in an early coding region
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet